Blastp是啥玩意儿？
今儿个咱们唠唠这个叫blastp的东西，听着挺玄乎，其实也没啥大不了的。说白了，这玩意儿就是个比对蛋白质的工具，就像拿照片找人似的。你给它一张蛋白质的照片，它就帮你从一大堆照片里头找出长得像的。
这blastp有啥用呢？用处可大了去了！比如说，你发现个新蛋白质，不知道它是干啥的，就可以用blastp查查，看看它跟谁长得像。没准儿就发现，原来它跟那个谁谁谁是一家人，功能也差不多。
还有，这blastp还能帮你看看，你这蛋白质是不是变异了。有时候，蛋白质会因为各种原因变异，长得跟原来不一样了。用blastp一比对，就能看出来，哦，原来是这儿变了，那儿变了。
咋用blastp？
用blastp其实也不难，就跟查字典差不多。你把要查的蛋白质序列输进去，再选个数据库，就像选字典一样。然后，点一下“开始”按钮，blastp就吭哧吭哧地帮你找去了。
- 第一步： 准备好你的蛋白质序列，这玩意儿就像你的照片，得清楚才行。
- 第二步：找个蛋白质数据库，这数据库就像个照片库，里头有好多好多蛋白质的照片。
- 第三步：打开blastp这个工具，把你的蛋白质序列输进去，再选个数据库。
- 第四步：点一下“开始”按钮，等着blastp出结果。
blastp的结果咋看？
blastp跑完了，会给你一堆结果，密密麻麻的，看着就头晕。别慌，咱慢慢看。
看那个“命中数”，这玩意儿就是告诉你，找到了多少个长得像的蛋白质。命中数越多，说明你这蛋白质越常见。
然后，看那个“位分”，这玩意儿就是告诉你，两个蛋白质有多像。位分越高，说明越像，亲戚关系越近。
再然后，看那个“相似性百分比”，这玩意儿也是告诉你，两个蛋白质有多像。百分比越高，说明越像。
blastp还有一些参数，可以调整比对的严格程度。这些参数就像照相机的滤镜，可以让你看得更清楚，或者更模糊。
比如说，有个参数叫“e值”，这玩意儿是告诉你，比对结果的可信度。e值越小，说明结果越可信。一般来说，e值小于0.05，就比较可信了。
还有个参数叫“空位罚分”，这玩意儿是告诉你，对蛋白质序列中的空位怎么处理。空位就像照片上的污点，有时候会影响比对结果。
blastp这大家伙，还能干不少别的活儿呢。它有五种不同的比对方式，就像五把不同的刷子，可以刷不同的东西。
- blastp：这是最常用的方式，就是蛋白质和蛋白质直接比，看看谁跟谁长得像。
- blastx：这玩意儿是把核酸序列翻译成蛋白质序列，再跟蛋白质数据库比。适合你只有核酸序列，没有蛋白质序列的情况。
- tblastn：这玩意儿是把蛋白质序列跟核酸数据库比。适合你想知道某个蛋白质是由哪个基因产生的。
- tblastx：这玩意儿是把核酸序列翻译成蛋白质序列，再跟核酸数据库翻译成的蛋白质序列比。这最复杂，适合你啥也不知道，只想碰碰运气。
- blastn:这玩意儿是核酸序列和核酸序列直接比，看看谁跟谁长得像。
blastp的过滤功能
blastp比对的时候，还会自动过滤一些没用的信息。就像照相的时候，会把一些杂物挡住，只让你看到你想看的东西。
blastp会过滤掉一些低复杂度的序列，这些序列就像照片上的噪点，会干扰比对结果。还会过滤掉一些重复的序列，这些序列就像照片上的水印，也会干扰比对结果。
blastp这玩意儿，是个好东西，能帮咱们解决不少问题。虽然看着有点复杂，但只要你肯学，肯琢磨，就能掌握它。
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